Statut du projet : En cours
Porteur du projet : Laboratoire SU-IMEV
Partenaires recherche : Laboratoire CNRS-LOV, Laboratoire IRCAN, Laboratoire CNRS-MIO
Année de labelisation : 2023

L’Imaging FlowCytoBot (IFCB) est un instrument automatisé qui génère des images d’objets (particules et organismes vivants) contenus dans un environnement aquatique. L’IFCB combine la cytométrie en flux et l’acquisition d’images à haute résolution (~ 3,4 pixels /μm) des objets dont le spectre de taille varie de 10 à 150μm (nano- et micro-plankton). La fluorescence induite par laser et la diffusion de la lumière par les objets servent à déclencher l’acquisition des images. Il est ainsi possible d’imager tous les objets (incluant les hétérotrophes et toute la matière détritique) ou de sélectionner seulement les objets auto-fluorescents (organismes phytoplanctoniques contenant de la chlorophylle). L’instrument peut soit échantillonner ponctuellement des échantillons collectés (e.g. issus de prélèvement par rosettes de bouteilles Niskin) ou de façon “continue” à raison de 15 ml d’eau de mer par heure (~30 000 images) lorsqu’il est immergé ou connecté à un système de circulation d’eau. Il fonctionne donc aussi bien sur paillasse que in-situ. Sa conception permet en particulier de prévoir des déploiements de moyenne durée (4 mois) sur des mouillages.L’acquisition de cet instrument permettra, en conjonction avec d’autres instruments déjà présents (Flowcam, Zooscan, UVP) dans la Plateforme d’Imagerie Quantitative de Villefranche sur mer (PIQv : http://piqv.imev-mer.fr) d’étendre la gamme de mesure (Figure 1) et d’obtenir une vue synoptique des organismes planctoniques depuis les bactéries jusqu’au macrozooplancton, tout en alliant informations taxonomiques, quantitatives et qualitatives (fluorescence, taille…).